Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms