Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
OPALINQ96PE5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OPALINQ96PE5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.7 ms