Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96MF0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Q96MF0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96MF0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96MF0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96MF0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96MF0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms