Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms