Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD2Q96BF3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms