Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABGGTAQ92696 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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