Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GIPC3Q8TF64 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms