Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms