Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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