Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCSAMQ8N6F7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSAMQ8N6F7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSAMQ8N6F7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSAMQ8N6F7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSAMQ8N6F7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSAMQ8N6F7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSAMQ8N6F7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSAMQ8N6F7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms