Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MSL3Q8N5Y2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms