Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDKL3Q8IVW4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKL3Q8IVW4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKL3Q8IVW4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKL3Q8IVW4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKL3Q8IVW4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKL3Q8IVW4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKL3Q8IVW4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKL3Q8IVW4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKL3Q8IVW4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKL3Q8IVW4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKL3Q8IVW4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKL3Q8IVW4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKL3Q8IVW4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDKL3Q8IVW4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms