Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP4Q86YS3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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RAB11FIP4Q86YS3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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RAB11FIP4Q86YS3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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RAB11FIP4Q86YS3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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RAB11FIP4Q86YS3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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RAB11FIP4Q86YS3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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RAB11FIP4Q86YS3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP4Q86YS3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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