Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP53Q70EK8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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