Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPGS1Q6ZTW0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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