Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC129Q6ZRS4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms