Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms