Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms