Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRRC38Q5VT99 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms