Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms