Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD5Q5TGI4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms