Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms