Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN4Q5BKX8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms