Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms