Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SVEP1Q4LDE5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SVEP1Q4LDE5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms