Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LONRF3Q496Y0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms