Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY8

ARL13B, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL13BQ3SXY8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL13BQ3SXY8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms