Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms