Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCB5Q2M3G0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB5Q2M3G0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms