Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
QSER1Q2KHR3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
QSER1Q2KHR3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
QSER1Q2KHR3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
QSER1Q2KHR3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms