Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IMPG1Q17R60 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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