Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR2Q16832 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR2Q16832 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms