Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPP1R3AQ16821 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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