Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPAQ15257 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms