Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD4Q14CM0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD4Q14CM0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms