Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A2Q14055 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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