Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP1Q13835 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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