Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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