Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEX6Q13608 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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