Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms