Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 KIAA2026-203ENST00000436015 932 ntTSL 35.46□□□□□ -1.542e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 BBX-221ENST00000458458 513 ntTSL 45.07□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NF1-219ENST00000579081 8788 ntTSL 1 (best)4.99□□□□□ -1.612e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.652e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.842e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 UBE3A-212ENST00000626589 394 ntTSL 53.32□□□□□ -1.882e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ARPP19-210ENST00000567830 275 ntTSL 33.15□□□□□ -1.912e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.882e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.852e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SLC19A1-204ENST00000427839 648 ntTSL 317.7■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 315.61■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.447e-12■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.282e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NR3C1-211ENST00000504336 611 ntTSL 25.4□□□□□ -1.542e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PPP1R10-206ENST00000484449 605 ntTSL 54.9□□□□□ -1.637e-12■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.742e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.782e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.912e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 LEMD3-203ENST00000541171 856 ntTSL 224.62■■□□□ 1.533e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TGFBR1-207ENST00000549766 1678 ntTSL 522.67■■□□□ 1.223e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.051e-11■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-201ENST00000464782 640 ntTSL 421.35■■□□□ 1.013e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-207ENST00000475734 578 ntTSL 520.92■□□□□ 0.943e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 OSBPL5-205ENST00000465323 674 ntTSL 220.8■□□□□ 0.923e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.913e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 HDAC4-209ENST00000487617 819 ntTSL 320.44■□□□□ 0.863e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-224ENST00000514527 660 ntTSL 320.05■□□□□ 0.83e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 MARK3-219ENST00000559328 533 ntTSL 419.83■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-215ENST00000510319 557 ntTSL 419.55■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-208ENST00000476617 596 ntTSL 419.48■□□□□ 0.713e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 OSBPL5-212ENST00000528124 567 ntTSL 418.77■□□□□ 0.63e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-221ENST00000495095 575 ntTSL 418.01■□□□□ 0.473e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 OSBPL5-206ENST00000471998 2182 ntTSL 217.94■□□□□ 0.463e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.413e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.391e-11■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 OSBPL5-215ENST00000533234 554 ntTSL 417.44■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-219ENST00000494358 578 ntTSL 1 (best)17.15■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.331e-11■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NPEPL1-207ENST00000529976 4684 ntTSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.151e-11■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NPEPL1-209ENST00000533788 899 ntTSL 515.71■□□□□ 0.111e-11■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ZNF75D-204ENST00000494295 1678 ntTSL 215.69■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 OSBPL5-219ENST00000534491 2224 ntTSL 1 (best)15.55■□□□□ 0.083e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NPEPL1-206ENST00000527587 4633 ntTSL 515.32■□□□□ 0.041e-11■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-225ENST00000514873 542 ntTSL 414.73□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.113e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.163e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.163e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.173e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.173e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-222ENST00000513974 548 ntTSL 413.87□□□□□ -0.193e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.223e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.263e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PTK2B-214ENST00000521164 554 ntTSL 413.43□□□□□ -0.264e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.263e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 OSBPL5-216ENST00000533721 774 ntTSL 413.28□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.33e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-11■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-226ENST00000514931 550 ntTSL 212.75□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-203ENST00000467634 571 ntTSL 412.67□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 MARK3-221ENST00000560603 572 ntTSL 412.5□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.453e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 OSBPL5-213ENST00000530372 575 ntTSL 412.17□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DHDDS-210ENST00000436153 705 ntTSL 212.04□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DHDDS-216ENST00000525682 1235 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.513e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SETD3-205ENST00000446066 1754 ntTSL 511.69□□□□□ -0.543e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PSMA6-206ENST00000554541 925 ntTSL 211.69□□□□□ -0.543e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DHDDS-203ENST00000374185 1148 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DHDDS-201ENST00000236342 1403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DHDDS-205ENST00000416052 629 ntTSL 310.97□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 CSE1L-201ENST00000262982 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.683e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NASP-225ENST00000629893 253 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NUDCD3-210ENST00000493613 613 ntTSL 310.52□□□□□ -0.733e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TGFBR1-209ENST00000552516 5933 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.743e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 OSBPL5-217ENST00000534157 706 ntTSL 410.42□□□□□ -0.743e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SETD3-208ENST00000489770 855 ntTSL 510.37□□□□□ -0.753e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 CSE1L-202ENST00000396192 3459 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-203ENST00000502736 569 ntTSL 410.26□□□□□ -0.773e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PSMA6-211ENST00000555764 1002 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.783e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DHDDS-202ENST00000360009 3245 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.833e-6■■■■□ 21.4
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