Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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