Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIAQ12857 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIAQ12857 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms