Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C2orf54Q08AI8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C2orf54Q08AI8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms