Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms