Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYP4F3Q08477 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms