Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms