Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms