Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS9P82933 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS9P82933 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms