Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms